云南主要有金沙江、澜沧江、红河、南盘江、怒江、伊洛瓦底江6大水系，有大小湖泊30多个。全省可发展航运的河道8000余公里。连接老挝、缅甸、泰国、柬埔寨、越南的澜沧江-湄公河国际航运的澜沧江-湄公河是亚洲唯一的一江连六国的国际河流。目前,澜沧江-湄公河航运已开通到泰国,中越红河航运开发的前期工作正在开展,金沙江航运可直达上海。

    目前我省通航里程已达2764公里，建成了景洪、思茅、水富、绥江、昆明、大理、关累等一批码头，港口通过能力达258万吨，589万人次；水上运输发展1192艘机动船、6.4万载重吨、2.3万个客位；平均运距为200多公里；水运科技事业也有了长足发展，“十五”期间，我省承担部、省港航工程、船舶技术、安全管理、信息化建设等水运科研项目18项，已有5项成果推广运用到水运建设中，多项科研成果达到了国际或国内领先水平。

    我省将尽快建成连接东南亚、南亚国家的对外通道，完善西南主骨架交通运输网络。重点建设和延伸三条对外通道：一是沿滇缅公路、中印公路和广大铁路西进通往缅甸，直达印度、孟加拉国等国的西路通道；二是由澜沧江—湄公河航运、昆明至打洛公路和西双版纳机场构成的通往老挝、缅甸、泰国并延伸至马来西亚和新加坡的中路通道；三是以滇越铁路、昆河公路及待开发的红河水运为基础，通往越南的东路通道。